10.3969/j.issn.1005-4561.2022.06.006
P4HA3基因与结直肠癌进展及不良预后的相关性研究
目的 探究脯氨酰4-羟化酶α-3(P4HA3)基因在结直肠癌(CRC)的表达及与不良预后的关系.方法 从The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取CRC基因数据,包含647例CRC患者肿瘤组织和51例癌旁组织.利用R软件对P4HA3表达及配对数据可视化分析.卡方检验分析P4HA3表达与CRC患者临床特征关系.利用R软件survival包对P4HA3进行生存分析.利用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库验证TCGA数据库CRC中P4HA3的表达.通过基因集富集分析(GSEA)对P4HA3进行京都基因与基因组百科全科(KEGG)通路富集分析.采用免疫组化染色检测30例CRC患者手术切除的肿瘤和癌旁组织蜡块样本中的P4HA3蛋白表达.结果 R软件分析显示,与癌旁组织比较,P4HA3在CRC组织高表达(P<0.01).卡方检验显示,P4HA3表达与CRC患者Stage、T和N分期密切相关(P<0.05).生存分析显示,与低表达P4HA3患者比较,P4HA3高表达CRC患者的生存时间明显缩短(P<0.05).通过GEPIA数据库分析验证了P4HA3基因与CRC不良预后相关(P<0.05).进一步GSEA通路富集分析结果显示,P4HA3基因富集到的信号通路与多种恶性肿瘤的发生发展有关(FDR<0.05).最后,免疫组化检测验证了P4HA3蛋白在CRC组织中高表达.结论 基因P4HA3与CRC的进展及不良预后相关,P4HA3有望成为CRC患者新的治疗靶点.
结直肠癌、P4HA3、生物信息学分析、预后分析、免疫组化
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R735.2;R541.4;R34
2022-06-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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