基于TCGA数据库的胃腺癌铜死亡相关lncRNA预后模型构建

摘要：

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库建立胃腺癌的铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)预后模型.方法 从TCGA数据库中获取胃腺癌的转录组数据和临床数据,检索相关文献获取铜死亡相关基因,应用Pearson相关分析确定胃腺癌铜死亡相关lncRNA.对目标lncRNA进行单因素Cox和套索算法回归分析,筛选出预后相关lncRNA,然后对其进行多因素Cox回归分析,根据预后模型公式计算风险评分,将患者分成高、低风险组进行生存差异分析.通过Kaplan-Meier曲线、主成分分析、ROC曲线、列线图评价预后模型的预测效能.对高、低风险组进行肿瘤微环境(TME)、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星状态、免疫逃逸和药物敏感性分析.结果 10个lncRNA被纳入构建预后模型,通过预后模型对样本进行生存分析发现,高风险组患者生存状况较差.主成分分析、ROC曲线证实该预后模型具有更高的灵敏度和准确度.单因素和多因素Cox回归分析显示年龄、临床分期和风险评分是预后的独立因子,以上述独立预后因子构建的列线图具有良好的区分度和一致性.进一步研究发现高风险组患者表现出更高的免疫浸润、低TMB、高度微卫星不稳定,并且高TMB和低风险的患者具有更好的预后.低风险组患者对更多的药物敏感,并且从免疫治疗中获益更多.结论 铜死亡相关ln-cRNA构建的预后模型可预测胃腺癌患者的预后,同时可反映患者TME及免疫治疗获益情况,从而为胃腺癌患者的药物选择提供参考依据.

关键词：胃腺癌、长链非编码RNA、预后、铜死亡

所属期刊栏目：45

分类号：R735.2;R687.3;R573

资助基金：中医药传承与创新“百千万”人才工程岐黄工程;宁波市医学重点学科建设项目

在线出版日期：2023-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：691-696,后插4-后插5