FOLFOX化疗结直肠癌患者CHRDL1基因表达特征及作用机制的生物信息学分析

摘要：

目的 探讨FOLFOX化疗结直肠癌(CRC)患者CHRDL1基因表达特征及作用机制.方法 利用基因表达汇编数据库下载化疗方案为FOLFOX的CRC患者的基因表达芯片数据集GSE69657,应用R软件筛选出差异基因.利用京都基因和基因组百科全书的基因集分析差异基因可能参与的信号通路,构建蛋白互作网络(PPI),分析差异基因与免疫检查点基因、免疫浸润细胞的关系.结果 分析获得以FOLFOX化疗为基础的CRC患者的差异基因86个,包括表达上调基因62个和表达下调基因24个,其中表达上调基因CHRDL1差异显著.不同肿瘤分期、肿瘤分化程度、淋巴结转移、TP53突变状态的CRC患者CHRDL1基因表达水平比较,差异均有统计学意义(均P＜0.05).CHRDL1基因可能参与的信号通路有11个,主要包括剪接体、磷酸化、切除修复、同源重组、RNA聚合酶、核苷酸切除修复、细胞周期、嘧啶代谢、DNA复制、错配修复、嘌呤代谢等.PPI显示,与CHRDL1基因存在直接互作关系的关键基因有RGMA、HFE2、NOG、BMP7、CHRD等,差异均有统计学意义(均P＜0.05).CHRDL1 基因与 PDCD1、CTLA4、HAVCR2、PDCD1LG2、SIGLEC15、CD274、LAG3、TIGIT 等免疫检查点基因关系密切(均P＜0.05),且与B细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞等免疫浸润细胞关系密切(均P＜0.05).结论 CHRDL1基因可能是预测奥沙利铂耐药CRC患者的潜在肿瘤标志物,其作用机制可能是通过调节核酸代谢和免疫机制来影响肿瘤细胞耐药.

关键词：FOLFOX、结直肠癌、CHRDL1基因、作用机制

所属期刊栏目：45

分类号：R734.2;S852.65;Q78

资助基金：杭州市卫生科技计划项目A20200024

在线出版日期：2023-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：594-598,后插3-后插4