基于生物信息学分析FOXO4在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 利用生物信息学方法分析叉头框蛋白O4(FOXO4)在肾透明细胞癌(简称肾癌)中的表达及临床意义.方法 Oncomine数据库可视化分析肾癌中FOXO4的表达,UALCAN数据库分析肾癌中FOXO4 mRNA和蛋白表达水平.采用CRISPR/dCas9方法使肾癌细胞系FOXO4过表达,RT-qPCR法检测肾癌细胞中FOXO4 mRNA表达水平.溴化噻唑蓝四氮唑法检测细胞存活能力.Kaplan-Meier plotter在线数据库分析FOXO4表达与肾癌预后的关系.使用4个在线数据库预测调控FOXO4表达的上游miRNA,通过StarBase数据库分析miRNA在肾癌样本中的表达及其与FOXO4表达的相关性,根据miRNA表达的中位值将肾癌样本分为高表达组和低表达组,分析预后关系.利用双荧光素酶报告基因实验验证它们的靶向调节关系.结果 从Oncomine和UALCAN数据库分析得到肾癌样本中FOXO4 mRNA和蛋白表达较正常肾组织样本均降低.769-P和786-O肾癌细胞中过表达FOXO4后其细胞存活水平均明显降低.Kaplan-Meier plotter在线数据库分析显示FOXO4低表达组总生存率低于高表达组.hsa-miR-142-3p是FOXO4表达的上游miRNA调控因子,其在肾癌样本中表达上调且与FOXO4表达呈负相关,hsa-miR-142-3p高表达不利于肾癌的预后.双荧光素酶报告基因结果显示hsa-miR-142-3p与FOXO4存在靶向调节关系.结论 FOXO4在肾癌中低表达,并与患者不良预后有关,有望成为改善肾癌预后的生物标志物和治疗的靶标.

关键词：肾透明细胞癌、叉头框蛋白O4、miRNA、生物信息学、预后

所属期刊栏目：44

分类号：R735.2;S826.2;Q78

在线出版日期：2022-12-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2298-2304,后插2