基于TCGA数据库构建前列腺癌相关miRNA预后模型
万方数据知识服务平台
应用市场
我的应用
会员HOT
万方期刊
×

点击收藏,不怕下次找不到~

@万方数据
会员HOT

期刊专题

10.12056/j.issn.1006-2785.2021.43.18.2021-213

基于TCGA数据库构建前列腺癌相关miRNA预后模型

引用
目的 利用癌症基因组图谱数据库(TCGA)中前列腺癌患者的miRNA和mRNA数据及临床信息,构建由miRNA组成的预后风险评分模型,为后续研究提供理论基础.方法 从TCGA数据库中下载有关前列腺癌的相关miRNA和mRNA数据,利用R语言进行生存预后分析及临床病理特征分析.利用TargetScan、miRDB和miRanda来预测差异表达miRNA潜在靶基因,并通过基因功能富集分析揭示前列腺癌中有效分子学机制.结果 miR-19a-3p、miR-144-3p、miR-223-5p和miR-483-3p这4种miRNA与前列腺癌患者总生存期密切相关.临床病理特征分析发现miR-483-3p表达量与T分期有关,miR-19a-3p表达量与患者年龄有关,miR-223-5p表达量与Gleason评分有关.功能富集分析显示,这4种miRNA的差异表达基因可能参与叉头转录因子和磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路.通过筛选共得出33个潜在靶基因.Kaplan-Meier生存分析显示,前列腺癌患者心肌肌动蛋白α1(ACTC1)、CD177、丝切蛋白2(CFL2)、肌蛋白修饰调节因子2(MBNL2)、含钯蛋白(PALLD)、磷酸二酯酶5A(PDE5A)、联丝蛋白(SYNM)或突触极蛋白2(SYNPO2)高表达组患者无病生存期均长于低表达组患者(均P<0.05).结论 miR-19a-3p、miR-144-3p、miR-223-5p和miR-483-3p等miRNA与前列腺癌预后有关,其潜在的靶基因ACTC1、CD177、CFL2、MBNL2、PALLD、PDE5A、SYNM、SYNPO2可用于评估前列腺癌患者的预后情况.

前列腺癌;生物信息学;预后;miRNA

43

2021-10-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共9页

1971-1978,前插3-前插4

相关文献
评论
暂无封面信息
查看本期封面目录

浙江医学

1006-2785

33-1109/R

43

2021,43(18)

相关作者
相关机构

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn