eRNA AP003059.2与乳腺癌患者预后的相关性分析——基于TCGA数据库

摘要：

目的 通过人类癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选乳腺癌中关键的增强子RNA(eRNA),探讨其与乳腺癌患者预后的相关性.方法 下载组织特异性增强子来源的长链非编码RNA(lncRNA)及其调控基因的列表,并下载TCGA数据库中相关的RNA测序数据和临床数据.通过生物信息学分析筛选与预后相关的eRNA,筛选标准为与肿瘤的总体存活率(Kaplan–Meier对数秩检验,P<0.05)和调控基因(相关系数r>0.4,P<0.001)具有显著相关性.结果 与乳腺癌总体存活率相关性最强的eRNA是AP003059.2,基因共表达分析显示包括苹果酸酶3(ME3)在内13个基因的表达与AP003059.2显著相关,AP003059.2可能通过影响这些基因的表达,从而在乳腺癌发生中发挥作用.结论 AP003059.2可能是乳腺癌中关键的eRNA,并且与乳腺癌的预后显著相关.

关键词：AP003059.2;长链非编码RNA;增强子;乳腺癌;苹果酸酶3

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资助基金：浙江省自然科学基金项目;浙江省中医药科技计划项目;浙江省医药卫生科技计划项目

在线出版日期：2021-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1605-1609