miR-4472的靶基因预测及生物信息学分析

摘要：

目的 应用生物信息学分析方法 预测miR-4472的靶基因及信号通路.方法 利用miRBase数据库分析miR-4472的物种保守性;利用Targetscan、miRDB数据库进行靶基因预测,再用DAVID数据库将miR-4472的预测靶基因集合进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析.结果 miR-4472预测的交集靶基因共378个.GO分析结果 显示,miR-4472的靶基因主要参与转录的正负调节、 细胞凋亡、 蛋白质磷酸化等生物过程(均P<0.01).KEGG信号通路分析结果 显示,miR-4472的靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、胰高血糖素相关信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导通路、醛固酮的合成和分泌相关信号通路(均P<0.05).结论 miR-4472靶基因富集的信号通路均与新生儿缺氧缺血性脑病密切相关,尤其是P13K/AKt信号通路.

关键词：新生儿缺氧缺血性脑病、miR-4472、靶基因、信号通路、生物信息学

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资助基金：浙江省自然科学基金一般项目;浙江省科技计划项目

在线出版日期：2020-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1377-1380