浸润性肺腺癌组织上调表达基因的筛选及验证

摘要：

目的 筛选及验证浸润性肺腺癌组织上调表达基因,寻找肺腺癌诊断和预后评估的新型分子标记物.方法 收集经手术病理证实的浸润性肺腺癌患者6例,制作癌组织及相应癌旁组织基因表达谱芯片,进一步通过Gene ontology、Pathway分析、标记物预测分析和基因网络关系分析方法对芯片数据进行处理,结合The Lung Cancer数据库检索与肺癌发生相关的mRNA信息,筛选出浸润性肺腺癌组织上调表达基因.另收集经手术病理证实的浸润性肺腺癌患者97例,抽提癌组织及相应癌旁组织RNA,逆转录,设计芯片筛选出的上调表达目的基因引物,实时荧光定量PCR技术(qPCR)扩增目的基因,以PUM1为内参基因,获得各样本组织△Ct值,与癌旁组织对比,分析103例癌组织目的基因表达情况.结果基因芯片数据结合数据库,初步筛选出浸润性肺腺癌组织14个上调表达基因,分别为SPINK1、ITGA11、TOX3、SPP1、MCM 10、MMP12、COL11A1、SIX1、FOXA1 、CLIC6、TMEM45B、GDF15、CEACAM1、ESR1.qPCR验证结果表明,与相应癌旁组织相比,SPINK1 mRNA、TOX3 mRNA、MMP12 mRNA、CLIC6 mRNA、TMEM45B mRNA在浸润性肺腺癌组织上调表达,差异均有统计学意义(P＜0.05或0.01),而ITGA11 mRNA、SPP1 mRNA、MCM10 mRNA、COL11A1mRNA、SIX1 mRNA、FOXA1 mRNA、GDF15 mRNA、CEACAM1 mRNA、ESR1 mRNA在肺腺癌组织表达未见上调,差异均无统计学意义(均P＞0.05).结论本研究成功筛选及验证SPINK1、TOX3、MMP12、CLIC6、TMEM45B mRNA水平在浸润性肺腺癌组织上调表达,提示可作为肺腺癌诊断和预后评估的新型分子标记物.

关键词：浸润性肺腺癌、基因芯片、差异表达基因、分子标记物

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资助基金：浙江省科技厅分析测试科技计划项目2015C37024;浙江省医药卫生科技计划一般项目2015KYB411;舟山市公益类科技项目2014C31065

在线出版日期：2018-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：224-230