阜新市HIV-1env基因C2～V4区序列特征分析

摘要：

目的 分析阜新市艾滋病病毒1型(HIV-1) env基因C2 ～ V4区序列及代表性广谱单克隆中和抗体的表位变异,为HIV-1变异趋势研究及阐明V3环与病毒生物学特征提供依据.方法 采集2018-2019年在阜新市卫生健康服务中心确证阳性的112例HIV-1感染者全血标本,采用巢式PCR扩增env基因C2～V4区核苷酸序列并测序,采用MEGA软件鉴定分型,采用HIV Database等软件分析V3环顶端四肽、辅助受体、净电荷和特征性氨基酸.结果 获得101条有效基因序列,发现5种V3环顶端四肽类型,其中GPGQ 77条,占76.24％,存在于CRF01_AE、CRF07_BC、CRF65_cpx和G亚型;GPGR 19条,占18.81％,存在于CRF01_AE、CRF07 BC和B亚型;GPGH 3条,GPGK和GPGA各1条,均只存在于CRF01_ AE亚型.辅助受体主要使用CCR5,84条占83.17％.CRF01_AE、CRF07_BC、B、CRF65_cpx和G亚型V3环净电荷数分别为3.28±1.17、3.22±0.92、4.25±0.83、2.50±0.50和3.结合b12和VRC01中和抗体表位氨基酸位点突变率为0～9.90％;295位和332位氨基酸N-糖基化位点缺失率分别为18.81％和14.85％,未发现两者同时缺失的情况.结论 2018-2019年阜新市HIV-1毒株主要是以CCR5为辅助受体的巨噬细胞嗜性非合胞体诱导型病毒,V3环顶端四肽以GPGQ为主,复制速度较慢,逃逸中和抗体能力较低.

关键词：艾滋病病毒1型、env基因、变异、包膜蛋白、V3环

所属期刊栏目：32

分类号：R512.91(传染病)

资助基金：国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治项目2017ZX10103007

在线出版日期：2020-12-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：983-986