4引物分子标记鉴定水稻高光效基因型hd3aKasa

摘要：

水稻的抽穗期关乎水稻的光合效率、适应季节和种植范围,其表现直接决定了水稻能否高产稳产.Hd3a编码的成花素是水稻抽穗调控通路中的关键因子,在短日照下促进抽穗,长日照下推迟抽穗.Hd3a包含多个等位基因,其中来自aus稻品种Kasalath的hd3aKasa相比来自温带粳稻品种日本晴(Nipponbare)的Hd3aNip,在第4个外显子处有2个连续的碱基突变(CC→AA),使得hd3aKKasa的功能强于Hd3aNip.hd3aKasa是高光效基因型,一般携带hd3aKasa的水稻品种产量更高,但会导致水稻开花推迟,可能影响其正常生产;而杂合态的Hd3aNip/hd3aKasa则表现出产量高和抽穗延迟适中,相比2种纯合基因型更加有利.由于Hd3a的不同等位基因各具优势,处于杂合状态下还可互补,因此建立可精确选择Hd3a等位基因的分子标记在育种实践中意义重大.本研究利用扩增受阻突变系统(Amplification refractory mutation system,ARMS)的原理,开发出包含4条引物的共显性分子标记hd3afnp,鉴定Hd3a的功能单核苷酸多态性(Functional nucleotide polymorphism,FNP).hd3afnp同表型完全连锁,1次PCR反应即可精确区分2种纯合等位基因型及其杂合基因型,从而有助于水稻的高光效分子标记辅助选择育种.

关键词：水稻、分子标记、抽穗期、成花素、高光效基因、Hd3a

所属期刊栏目：35

分类号：S511.01;Q75(禾谷类作物)

资助基金：中国农业科学院创新工程项目CAAS-XTCX2016002

在线出版日期：2020-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：75-80