马铃薯StUOXs基因家族的生物信息学分析

摘要：

马铃薯(Solanum tuberosum)是世界第三大粮食作物,其产量和品质受到生物与非生物胁迫的影响.泛醌氧化酶(ubiquinol oxidase,UOX)是一种由核基因编码的线粒体末端氧化酶,在植物生长发育及胁迫应答中发挥重要作用.为了解StUOXs在马铃薯抗病过程中发挥的应答反应,利用生物信息学方法在马铃薯基因组中鉴定出5个StUOXs基因,对其理化性质、染色体定位、三级结构、进化关系、保守结构域、启动子元件和表达谱尤其是受青枯菌(Ralstonia solanacearum)诱导的表达模式进行了分析.结果 表明:马铃薯StUOXs基因编码的氨基酸数在279～366,相对分子质量为31～42 ku,亚细胞定位在线粒体中;系统进化分析发现,马铃薯StUOXs成员与番茄、辣椒的UOXs成员的亲缘关系最近,较之拟南芥、烟草亲缘关系稍远;FPKM数据分析发现,StUOXs主要受盐、激素和生物胁迫诱导而在叶片中表达,这与其启动子中的存在的激素应答等顺式作用元件相对应.青枯菌接种后的qRT-PCR实验表明,StUOX4参与马铃薯青枯病的早期应答反应.

关键词：马铃薯、StUOXs、序列特征、生物信息学分析

所属期刊栏目：32

分类号：S532(薯类作物)

资助基金：国家自然科学基金;山西师范大学文理学院基础研究基金

在线出版日期：2020-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1523-1532