萝卜属抽薹开花相关基因 FLC的预测及分析

摘要：

以控制拟南芥春化途径的关键基因FLC全长CDS为参考序列，在萝卜属（ Raphanus） EST数据库中进行BLASTN检索，得到具备Score≥100、E-value≤10-10和coverage ≥70％条件的70条萝卜ESTs作为候选的拟南芥FLC基因的同源ESTs，并进行序列聚类拼接、注释及分析。结果显示：在普通萝卜和野生萝卜中各发现两个旁系同源基因（ RsFLCa和RsFLCb及RrFLCa和RrFLCb）。 RFLCs与拟南芥FLC间在核酸水平上的一致性为78.7％～86.9％；RFLCs旁系同源基因间的一致性为75.9％～93.4％；RFLCs与芸薹属FLC直系同源基因间的一致性绝大多数维持在85％以上，且高于与拟南芥直系同源基因间的一致性。系统进化分析发现，与白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中FLC多拷贝产生的机制可能类似，萝卜属FLC基因的多拷贝现象可能也是伴随萝卜基因组的多倍化而产生的。

关键词：十字花科、萝卜属、开花时间基因

分类号：S631.1;Q943.2(蔬菜园艺)

资助基金：江苏省科技支撑计划项目BE2012342；江苏省农业科技自主创新资金项目[CX122006]；盐城市农业科技发展计划项目YC201003

在线出版日期：2014-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：656-660