Asia1型口蹄疫病毒基因组的测序分析

摘要：

对中国口蹄疫病毒Asia1/JS/2005毒株的全基因组进行了分段扩增并测序。结果表明，该毒株的基因组全长为8174 nt，其中5’UTR为1092 nt；ORF为6990 nt；3’UTR为92 nt。利用DNAstar软件对该毒株和Asia1型其他24毒株基因组序列进行同源性分析表明，该毒株的非结构蛋白和5’UTR比较保守。研究还发现了可能与生物学功能相关的新的保守和变异区域。系统树分析表明Asia1/JS/2005， Asia1/1/YZ/2006， Asia1/WHN/2006，Asia1/HN/2006和Asia1/YS/2005属于同一分支，表明这些毒株间有着紧密的遗传关系，其中与其亲缘关系最为密切的是Asia1/YS/2005。

关键词：口蹄疫病毒、Asia1/JS/2005、基因组

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项基金项目1610322013023

在线出版日期：2014-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：290-296