不同组织及干旱胁迫下黄薇内参基因的筛选与验证

摘要：

[目的]为黄薇Heimia myrtifolia不同组织及不同干旱胁迫下基因表达分析筛选最适内参基因.[方法]选取黄薇盛花期的根、茎、叶、花,以及5种不同干旱处理的叶片作为实验材料,借助RT-qPCR技术对黄薇转录组数据筛选的9个候选内参基因进行分析,并利用软件geNorm、BestKeeper、NormFinder和RefFinder综合评价候选基因的表达稳定性.最后选取2个与胁迫相关的基因CSLD和SOD,对所选内参基因进行验证.[结果]geNorm、BestKeeper和NormFinder分析得出的候选内参基因排序存在一定差异.利用RefFinder对上述3个软件的结果综合分析得出:在不同组织中,最稳定的内参基因为GAPDH,最不稳定的内参基因为TUA;在干旱胁迫中,最稳定的内参基因为GAPDH,最不稳定的内参基因为TUB.在全部样本中,最稳定的内参基因为GAPDH,最不稳定的内参基因为18S RNA.对不同组织和干旱胁迫下的CSLD和SOD基因表达模式进行验证表明:上述2个基因与筛选所得内参基因的表达量和变化趋势均较为一致.[结论]在不同组织和干旱处理后,GAPDH是最适合黄薇基因表达的内参基因.

关键词：黄薇、实时荧光定量PCR、内参基因

所属期刊栏目：40

分类号：S718.46(林业基础科学)

资助基金：浙江省农业新品种重大专项;浙江省自然科学基金资助项目

在线出版日期：2023-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：665-672