桂花OfACOs基因家族鉴定及表达分析
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10.11833/j.issn.2095-0756.20220783

桂花OfACOs基因家族鉴定及表达分析

引用
[目的]对桂花Osmanthus fragrans乙烯合成路径氨基环丙烷羧酸氧化酶(1-aminocyclopropane-1-carbox-ylate oxidase,ACO)基因家族进行了全基因组鉴定及表达分析,以探索参与桂花花瓣乙烯合成的关键ACO家族成员.[方法]以桂花品种'柳叶金桂'O.fragrans'Liuye Jingui'为参考基因组,对桂花OfACOs家族进行鉴定、进化分析、基因结构分析以及根、茎、叶、芽和不同开花阶段的表达模式分析.[结果]通过蛋白保守结构域(protein families,pfam)分析,从桂花基因组中共鉴定出了122个OfACOs成员,分布于22条染色体上;保守基序分析表明:大多数OfACOs基因同时包含Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 7这5个保守基序,它们共同组成OfACOs保守结构域;共线性分析结果表明:与拟南芥Arabidopsis thaliana基因为共线性对的基因可能具有相似的功能.结合swiss-prot同源序列对比分析,筛选出27个成员作为候选研究对象,进行不同组织部位根、茎、叶、芽和不同开花阶段的转录组测序分析,结果发现:12个成员在花瓣中显著表达,其中LYG006223、LYG007706、LYG007045、LYG035696等4个成员在开花后期极显著差异上调表达.进一步对该4个成员进行荧光定量PCR验证分析,结果与转录组测序结果一致.[结论]通过OfACOs基因家族的全基因组鉴定及基因克隆分析,筛选到在开花后期显著差异上调的4个ACO家族成员可能参与桂花花瓣衰老的调控.

桂花、OfACOs、乙烯、衰老、基因家族

40

S722.3(造林学、林木育种及造林技术)

国家自然科学基金;国家自然科学基金;湖北省科技创新专项;湖北省中央引导地方专项

2023-06-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共10页

492-501

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浙江农林大学学报

2095-0756

33-1370/S

40

2023,40(3)

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