杜仲WOX家族基因鉴定及在叶片发育中的表达

摘要：

[目的]Wuschel(WUS)相关的同源异型盒(Wuschel-related homeobox,WOX)转录因子家族在植物生长发育中发挥重要作用.本研究旨在探索WOX转录因子在杜仲Eucommia ulmoides中的分布及表达特征.[方法]以杜仲基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对杜仲WOX家族进行全基因组鉴定;基于转录组数据分析EuWOXs在叶片发育及杜仲胶形成中的表达特征,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测EuWOXs在'紫叶'杜仲'Ziye'叶片不同发育时期的表达模式.[结果]杜仲基因组中共鉴定出8条EuWOXs,分布于8条染色体;EuWOXs蛋白质长度为182～352个氨基酸,理论等电点为5.10～6.47,分子量为20.7～40.4 kDa;亚细胞定位预测EuWOXs均定位在细胞核中,均为亲水性蛋白.根据系统进化关系,杜仲WOX家族包括3个亚家族,分别含2、1和5个EuWOXs基因.EuWOXs均含有内含子,并包含多个基序,启动子中富含激素、胁迫和光周期响应元件.大部分EuWOXs 在杜仲叶片中表达量较低,EuWOX13-1随叶片发育表达量逐渐降低,EuWOX13-2在生长叶中表达量最高.[结论]杜仲中有8个EuWOXs基因,EuWOX13-1和EuWOX13-2可能在杜仲叶片发育中发挥重要作用.

关键词：杜仲、WOX家族基因、生物信息学分析、基因表达、叶片发育

所属期刊栏目：40

分类号：S718.4;Q754(林业基础科学)

资助基金：河南省科技研发计划联合基金项目;河南省高等学校重点科研项目;国际竹藤中心安徽太平试验中心开放课题;国家林业;草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室开放基金;河南中医药大学博士科研启动基金

在线出版日期：2023-02-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

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