光皮桦AP2/ERF基因家族鉴定与表达分析

摘要：

[目的]深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能.[方法]利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作和表达分析.[结果]在光皮桦基因组中共鉴定到77个AP2/ERF基因,其编码的蛋白理化性质存在差异,大多数蛋白(60个)的理论等电点小于7.0.系统进化分析显示:这77个AP2/ERF转录因子属于5个亚家族,其中ERF亚家族最大,包含34个成员.光皮桦AP2/ERF各亚家族间的基因结构存在较大差异,其中AP2亚家族成员均具有6～9个内含子,而DREB亚家族基因则没有内含子;但AP2/ERF各亚家族内的不同成员具有相似的保守基序类型和分布.同时,AP2/ERF基因启动子上都存在大量与激素、调节、胁迫响应及生长发育相关的顺式作用元件.此外,互作网络分析预测不同的光皮桦AP2/ERF亚家族蛋白间存在广泛的互作关系.进一步的表达分析显示:绝大多数光皮桦AP2/ERF基因(71个)的表达存在较强组织特异性,且在高温胁迫下,多数ERF或DREB基因的表达发生显著变化,表明ERF和DREB基因在高温胁迫应答中可能发挥着重要作用.[结论]通过生物信息学分析获得光皮桦77个AP2/ERF基因,分属于5个亚家族.不同亚家族基因具有相似的基因结构、保守基序等特征.基因启动子区含激素、胁迫响应等相关的作用元件.基因表达具有较强的组织特异性,且多数ERF或DREB基因对高温胁迫有明显响应.

关键词：光皮桦、AP2/ERF家族、表达模式、高温胁迫

所属期刊栏目：39

分类号：S722.3(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家自然科学基金;浙江省重点研发计划项目

在线出版日期：2022-12-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1183-1193