毛果杨ZHD家族全基因组水平鉴定及在干旱胁迫下的表达分析

摘要：

[目的]对毛果杨Populus trichocarpa ZHD(PtrZHD)家族进行生物信息学以及干旱胁迫下表达特性分析,为研究PtrZHD在干旱胁迫中的功能提供参考.[方法]利用生物信息学方法从全基因组水平鉴定出毛果杨ZHD家族全部成员,并对其进化、理化性质、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件和表达特性进行分析.[结果]毛果杨ZHD家族包括21个成员,可分为7个亚家族;有8对同源基因,且非同义替换率(Ka)/同义替换率(Ks)值远小于1.该家族成员理化性质存在差异,但其结构较为保守,均含有Motif 1;启动子区含有数量不等的激素和非生物胁迫响应元件,不同基因之间响应元件的种类存在差异.在毛果杨PtrZHDs中,分别有1、7和13个基因在根、茎和叶组织中具有偏好性表达特征;PtrZHD家族成员对干旱胁迫的响应具有组织和时间表达特异性,在根、茎和叶部组织中各成员的表达量不同,但随着干旱胁迫时间的增加均呈先上升后下降的趋势.[结论]PtrZHD家族基因对干旱胁迫有不同程度的响应,可调控毛果杨对干旱胁迫的应答.

关键词：毛果杨、ZHD家族基因、生物信息学分析、组织表达、干旱胁迫

所属期刊栏目：39

分类号：S722.3(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家自然科学基金;中央级公益性科研院所基本科研业务费

在线出版日期：2022-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：465-474