景宁木兰PIF转录因子的生物信息学分析及极端遮阴条件下的表达模式

摘要：

[目的]群落所造成的遮阴是导致景宁木兰Magnolia sinostellata濒危的重要因素之一.PIF家族转录因子在光信号传导和植物生长发育中起到重要作用.对PIF家族转录因子进行系统分析和研究,为探究其在景宁木兰光信号转导机制中的作用奠定基础.[方法]从景宁木兰转录组数据中鉴定获得PIF家族转录因子并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术对其在极端遮阴条件下的表达模式进行分析.[结果]从景宁木兰转录组中共筛选出9个MsPIFs转录因子基因,其编码的蛋白质长度为188～735个氨基酸,蛋白质大小为20314.56～78957.02 Da,理论等电点范围为5.18～8.22.MsPIFs基因编码的蛋白质均为不稳定蛋白质,所有蛋白质均为亲水性蛋白质.亚细胞定位预测结果显示所有蛋白质均定位于细胞核.9个蛋白质均具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Try)磷酸化位点.qRT-PCR结果表明:极端遮阴条件下,9个MsPIFs家族基因表达均发生不同程度的变化.其中,MsbHLH23的表达变化较其他基因更为明显,遮阴处理5和10 d时的表达量分别上调为对照的52.77与20.03倍.[结论]景宁木兰PIF转录因子家族均能响应遮阴,为后续对MsPIFs进行生物学功能鉴定奠定了基础.

关键词：景宁木兰、极端遮阴、PIF转录因子家族、生物信息学分析、表达模式

所属期刊栏目：38

分类号：S718.3(林业基础科学)

资助基金：十三五浙江省林木新品种选育专项;浙江省重点研发项目

在线出版日期：2021-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：445-454