西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

摘要：

以西洋杜鹃Rhododendron hybridum功能叶片为试验材料,采用改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取西洋杜鹃基因组DNA,并且运用L16(44)正交试验设计,在4个水平上对影响西洋杜鹃相关序列扩增多态性(SRAP)反应的镁离子(Mg2+)浓度、Taq酶用量、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs)浓度、引物浓度等4个因素进行了优化,确立了一套适用于西洋杜鹃的稳定可靠、重复性强的SRAP-PCR反应体系.实验发现,其最佳反应体系(20.0 μL)为:Mg2+浓度1.750 mmol·L-1,dNTPs浓度0.175 mmolL-1,Taq酶1.500×16.67 nkat,引物0.200 μmolL-1.利用该优化体系对24个西洋杜鹃花品种进行遗传多样性分析.从88对SRAP引物中筛选出10对扩增清晰且多态性高的引物,共扩增出217条带,其中多态性条带212条,多态性比率达97.35％.24个杜鹃品种的遗传相似系数变化范围为0.591～0.708,算术平均数的非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析结果显示:在相似系数为0.590处将24个供试品种分为2个类群,在相似系数为0.623处又可分为2个亚群,说明该优化体系可应用于西洋杜鹃花品种鉴定及遗传多样性的研究.

关键词：植物学、西洋杜鹃、遗传多样性、SRAP-PCR、正交设计、体系优化、聚类分析

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分类号：Q946;S685.21(植物学)

资助基金：浙江省重大科技专项重点农业项目2009C12092;宁波市科技创新创业重点项目2010C92021

在线出版日期：2014-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：844-851