山核桃SSR标记的初步开发

摘要：

基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物；建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验.结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8％.将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点.结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的.

关键词：经济林学、EST-SSR、山核桃、cDNA文库

所属期刊栏目：29

分类号：S664.1;S718.3(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30771752;浙江省自然科学基金资助项目Y306373;浙江农林大学研究生科研创新基金资助项目2112010002

在线出版日期：2012-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：626-633