马氏珠母贝Perlucin基因序列特征及其SNP与耐低温性状的关系

摘要：

[目的]克隆马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)新的凝集素分子基因,命名为Perlucin,研究在低温胁迫下马氏珠母贝Perlucin的表达以及与抗低温性状相关的单核苷酸多态性(SNP)位点.[方法]根据马氏珠母贝基因组中Perlucin基因序列设计引物,克隆Perlucin基因全长;用生物信息学方法分析Perlucin的结构和理化特征;设计17和22℃(对照)2个温度组,对马氏珠母贝进行低温胁迫实验,用实时荧光定量PCR检测低温胁迫下Perlucin表达量的变化;筛选和比较分析马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部湾野生群体(W)的Perlucin外显子区的SNP位点和单倍型.[结果]马氏珠母贝Perlucin全长631 bp,编码152个氨基酸;包含1个信号肽和1个C型凝集素结构域.同源分析表明,马氏珠母贝Perlucin与紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)Perlucin的亲缘性最近.Perlucin在鳃中表达量最高,其次为足和肝胰腺.低温胁迫时,鳃组织中Perlucin基因在17℃低温组的表达量呈先升高后降低的趋势,在12h时达到最高并显著高于22℃对照组(P<0.05),表明Perlucin可能参与马氏珠母贝的低温响应过程.对Perlucin外显子区的SNP进行分析,共得到30个SNP,其中13个SNP位点的基因型频率在R和W群体间差异显著(P<0.05).[结论]Perlucin是参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因,筛选出两个SNP位点g.40078856、g.40078945.

关键词：马氏珠母贝、Perlucin、基因克隆、低温胁迫、SNP

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分类号：S968.31;Q953+.1(水产养殖技术)

资助基金：广东省自然科学基金;广东省普通高校重点领域专项;广东省现代农业产业技术体系-贝藻类产业创新团队项目;湛江市科技计划

在线出版日期：2024-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：55-63