全基因组重测序筛选弓背青鳉三亚群体性别遗传标记

摘要：

[目的]开发弓背青鳉(Oryzias curvinotus)三亚群体(下称"三亚青鳉")遗传性别鉴定分子标记,为进一步挖掘其性别决定基因奠定基础.[方法]用染色体商(Chromosome quotient,CQ)法比较雌雄两性个体的全基因组重测序覆盖度,筛选潜在的性别特异性序列区域(CQ<0.1)并设计引物,通过PCR扩增验证引物区分三亚青鳉群体及其子代性别的适用性.[结果]经CQ分析筛选,CQ<0.1的特异性区域279个,设计引物279对.随机挑选的60对引物中,29对标记引物在三亚青鳉群体雄鱼中扩增得一个DNA条带,雌鱼无条带,均可鉴定三亚青鳉遗传性别.从29对引物中随机挑选2对引物(命名为Marker1和Marker2)进一步验证,引物Marker1、Marker2在雄鱼中扩增产物分别为791、556 bp,两对引物对三亚青鳉子代群体的扩增结果与亲本一致.用两对性别特异性标记对三亚群体的F2代全同胞家系94个个体进行扩增,结果发现F2群体自然性别比约1∶1.[结论]性别特异性引物Marker1和Marker2均可对三亚青鳉群体进行遗传性别鉴定,在三亚青鳉野生亲本及其子代中均有稳定性和通用性,可用于弓背青鳉三亚群体遗传性别鉴定.

关键词：弓背青鳉、三亚群体、性别特异性标记、重测序、染色体商区域、自然性别比

所属期刊栏目：43

分类号：S917;Q953+.3(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;粤桂联合基金-面上项目

在线出版日期：2023-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：69-75