不同生长速率花鲈肌肉转录组分析及生长相关基因筛选

摘要：

[目的]筛选与花鲈肌肉生长相关的基因和信号通路,为揭示花鲈肌肉生长发育的遗传机制提供理论依据.[方法]分别取4尾生长快速[体长(34.22±2.53)cm]和4尾生长慢速[体长(17.46±1.78)cm]的花鲈个体肌肉进行转录组测序.用DESeq2 R软件包筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行GO富集和KEGG富集分析.通过实时荧光定量PCR验证转录组数据的准确性.[结果与结论]测序原始数据经过质量控制和组装共得到137960个unigenes,其中68334个unigenes在Nr中注释成功.获得10552个DEGs,其中2064个DEGs表达量上调,8488个DEGs表达量下调,鉴定出胰岛素样生长因子结合蛋白1基因(IGFBP1)、纤维细胞生长因子基因(FGF)、肌肉生长抑制素基因(MSTN)、生长激素受体1基因(GHR1)等与肌肉生长发育相关的基因.DEGs的GO富集结果显示,与物质和能量代谢相关的条目差异显著.KEGG富集结果显示,糖酵解/合成、腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)、脂肪酸降解、精氨酸和脯氨酸代谢等信号通路与肌肉生长密切相关.

关键词：花鲈、转录组、差异表达基因、GO富集、KEGG富集

所属期刊栏目：42

分类号：S917.4;Q783(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;广东省重点领域研发计划项目;中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;广州市科技计划项目;广州市农村科技特派员项目;中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项

在线出版日期：2022-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：9-17