10.3969/j.issn.1673-9159.2021.02.001
波吉卵囊藻胞外滤液对铜绿微囊藻转录水平的影响
[目的]探索波吉卵囊藻胞外滤液对铜绿微囊藻的抑制机理.[方法]采用Illumina平台,对使用BG11培养基(对照组)和波吉卵囊藻胞外滤液(实验组)培养的铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)进行转录组测序,筛选差异表达基因并进行通路富集分析,并对部分差异表达基因进行qRT-PCR验证.[结果]与对照组相比,波吉卵囊藻胞外滤液处理后的铜绿微囊藻组中筛选1483个表达差异显著的基因,其中上调表达基因788个,下调表达基因695个.GO功能分析将差异基因划分为35个子类别,包括催化活性、结合、代谢过程、细胞过程、膜、膜部分等.KEGG通路分析中,所有差异基因聚集在108个通路,其中84个差异基因注释在代谢功能类别中,而氧化磷酸化通路富集最显著.氧化磷酸化通路中,相关基因表达以上调为主(26个DEGs,20个上调,6个下调).qRT-PCR验证结果与转录组测序结果的表达变化趋势一致.[结论]波吉卵囊藻滤液引起铜绿微囊藻氧化磷酸化途径上基因表达上调,ATP合成效率提高.
铜绿微囊藻、胞外滤液、转录组、波吉卵囊藻、化感作用、差异表达基因、基因功能
41
Q948.12+2.1;X52(植物学)
广东省普通高校青年创新人才项目2018KQNCX102,2018KQNCX110
2021-04-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
1-9