金钱鱼基因组微卫星分布特征分析及多态性标记开发

摘要：

[目的]研究金钱鱼(Scatophagus argus)全基因组微卫星分布特征,筛选高多态性微卫星(SSR)标记.[方法]利用MISA软件对金钱鱼基因组中微卫星进行筛选并分析分布特征,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点.[结果与结论]金钱鱼基因组总共挖掘390967个SSR位点,相对丰度为653个/Mb.二碱基重复类型最多(52.64％),微卫星标记整体偏向A+T碱基组合.筛选出23对多态性标记位点,其中7对的等位基因数为4～11,期望杂合度为0.431～0.859,观测杂合度0.417～0.861,多态性含量为0.389～0.830.经Bonferroni校正后,5个位点符合哈德温伯格平衡,且位点间不存在连锁不平衡现象.

关键词：金钱鱼、基因组survey测序、微卫星、标记开发

所属期刊栏目：40

分类号：Q78;Q959.483(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家重点研发计划;广东省自然科学基金;广东省自然科学基金;广东省科技厅科技创新战略专项重点项目;广东省普通高等学校青年创新人才项目

在线出版日期：2020-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：7-14