溶藻弧菌acfA基因克隆与生物信息学分析

摘要：

溶藻弧菌引起海水养殖产业弧菌病的主要病原，附着定植因子基因acfA是溶藻弧菌重要毒力基因之一，其表达产物是溶藻弧菌有效定植在宿主肠道上所必需的蛋白。根据弧菌属细菌acfA基因基因保守区设计引物，采用Touchdown PCR扩增acfA基因部分序列，Inverse PCR和Nested PCR扩增已知序列侧翼序列，成功克隆了溶藻弧菌acfA基因全长。克隆的acfA基因序列全长为743 bp，开放阅读框长度为648 bp组成，共编码215个氨基酸，在5′端上游未发现-35区和-10区序列。演绎的ACFA蛋白N端有18个氨基酸信号肽序列，表明该蛋白是分泌型蛋白；蛋白结构分析表明主要由α螺旋和不规则卷曲构成。BLAST分析表明，该蛋白氨基酸序列与其他弧菌相应蛋白同源性较高，是较保守的外膜蛋白。

关键词：溶藻弧菌、acfA基因、克隆、蛋白结构

分类号：Q785;S941.42(基因工程（遗传工程）)

资助基金：广东省教育厅育苗工程项目2012LYM_0072

在线出版日期：2014-04-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：9-14