环境16S rDNA和16S rcDNA序列分析湖光岩玛珥湖的浮游细菌组成

摘要：

　　通过提取环境总16S rDNA和总16S rRNA分别构建DNA克隆文库和反转录cDNA文库，并进行克隆测序和序列分析，探讨湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性细菌的遗传多样性。结果表明：构建两个水层的4个克隆文库，即1 m和10 m水层总菌的16S rDNA文库和总活性菌的16S rcDNA文库，共获得413条序列，分属15门、32目、52科；1 m 水层的 rDNA 文库与 rcDNA 文库中 Verrucomicrobia 类群所占比例最大（36.8%和32.1%），其次为Alphaproteobacteria（15.1%和16%）和Betaproteobacteria（17.9%和16%）；在10 m水层的2个文库中，Alphaproteobacteria类群均占绝对优势，分别为63.5%（rDNA）和43.8%（rcDNA），其次为Verrucomicrobia（11.5%和14.3%），其他细菌类群包括Acidobacteria、Chloroflexi、Firmicutes、待定门OD1、Planctomycetes、Spirochetes和Deltaproteobacteria，比例在0.8%~3.8%之间；在科的水平上，SAR11为湖光岩玛珥湖最为丰富的类群，占总克隆数的26.9%，其中在10 m水层的比例高达51.5%。序列同源性分析表明，绝大多数序列（89.8%）来源于新种，其中19.6%的序列可能来自于新属，69%的序列可能来自于全新的科。湖光岩玛珥湖浮游细菌群落结构较为独特，有大量的浮游细菌种类尚未获得相应的纯培养物，蕴含着丰富而新颖的微生物资源。

关键词：湖光岩玛珥湖、浮游细菌、浮游活性菌、16S rDNA、16S rRNA、系统发育分析、遗传多样性

分类号：Q939.19(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金青年项目30900045;广东省自然科学基金博士启动项目B09292

在线出版日期：2013-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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