基于全基因组重测序技术的甘蓝型油菜光叶突变体基因定位

摘要：

表皮蜡质是油菜适应逆境的保护措施之一.本课题组前期报道了一个由1对显性基因控制的甘蓝型油菜(Brassica napus L.)光叶突变体DL22B077-1.为了进一步了解其遗传机制,本研究利用全基因组重测序技术和分离群体分析法(bulk segregated analysis,BSA)通过F2群体进行基因定位,获得的有效碱基数达10 661.75 Mb,其中,Q30均值为92.99%,平均作图率为97.73%,平均测序深度为24×,平均覆盖率为82.06%,测序质量较高;此外,分析了单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记和插入-缺失(insertion-deletion,In-Del)标记与光叶性状的相关性.通过SNP标记,在5条染色体上得到7个相关区域和1 509个相关基因.通过In-Del标记,在11条染色体上得到15个相关区域和2 633个相关基因.SNP标记和In-Del标记关联分析结果的交集部分为C8染色体上8.60～10.39 Mb区域,总长度为1.79 Mb,共计130个候选基因,其中119个基因得到注释,它们参与了细胞成分的构建,确保了分子功能和生物过程的顺利进行.DL22B077-1是第一个将蜡质基因定位到C8染色体上的甘蓝型油菜光叶突变体,据此判断其为新的光叶突变体.上述结果为选育高产稳产油菜品种、改良油菜抗逆栽培技术奠定了理论基础.

关键词：甘蓝型油菜、光叶突变体、全基因组重测序、基因定位

所属期刊栏目：49

分类号：S565.4;Q343.17(经济作物)

资助基金：国家重点研发计划;现代农业产业技术体系

在线出版日期：2023-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：497-506