黔北黑猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选

摘要：

选取5头12月龄的健康黔北黑猪,屠宰后分别取其背最长肌(longissimus dorsi muscle,LDM)和腰大肌(psoas major muscle,PMM),一部分用于检测总脂肪含量,另一部分用于提取总RNA、建库及测序.将获得的重叠群与猪RefSeq数据库进行比对,获得注释基因.利用DESeq21.26.0软件分析差异表达的mRNA,并经GOseq 1.15.5软件和KOBAS 3.0软件对差异表达的mRNA进行基因本体(gene ontology,GO)以及京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路分析;然后通过实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)对筛选出的与脂肪沉积相关的候选基因进行验证.结果表明,PMM中的脂肪含量极显著高于LDM(P<0.01).通过高通量测序,共获得162个差异表达基因,其中66个上调,96个下调.通过GO、KEGG分析并结合功能查找,筛选出6个与脂肪沉积相关的差异表达基因,qRT-PCR验证结果显示,LPL、PPARA、COX2、PRKAG2和SCD在LDM和PMM中的表达情况存在显著差异.本研究结果为探究黔北黑猪肌内脂肪沉积的分子机制奠定了基础,也为黔北黑猪的保护、开发和利用提供了实验依据.

关键词：黔北黑猪;背最长肌;腰大肌;差异表达基因;脂肪沉积

所属期刊栏目：47

分类号：S828.8(家畜)

资助基金：贵州省教育厅青年科技人才成长项目;贵州省科技计划;贵州省重点实验室项目;贵州省铜仁市科学技术局科技支撑计划;铜仁学院生态畜牧创新团队项目

在线出版日期：2022-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：797-804