罗氏沼虾谷氨酸脱氢酶基因克隆及其在MrTV感染下的组织表达分析

摘要：

本研究利用cDNA末端快速扩增技术克隆获得罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)谷氨酸脱氢酶(glutamate dehydrogenase,GDH)基因(MrGDH)的cDNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并检测该基因在罗氏沼虾不同组织中的表达差异;同时,利用罗氏沼虾太湖病毒(Macrobrachium rosenbergii Taihu virus,MrTV)感染沼虾,研究感染前后沼虾鳃和肝胰腺MrGDH的转录特征.结果显示,MrGDH基因cDNA序列全长2257 bp,拥有一个1662 bp长的开放阅读框,合计编码氨基酸553个,合成的蛋白质分子质量约为61.37 kDa.MrGDH氨基酸序列与中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)、凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的同源性较高,达到92%,其二级结构和三维结构与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)以及家蚕(Bombyx mori)高度相似,说明MrGDH氨基酸序列比较保守.实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)结果显示,MrGDH基因在与机体运动和代谢有关的组织中表达量较高,其中在肌肉中表达量最高,而在血淋巴中最低.罗氏沼虾受MrTV病毒感染48 h,肝胰腺和鳃中MrGDH基因的表达在统计学上均极显著高于对照组(P<0.01);感染72 h,鳃中MrGDH基因表达显著高于对照组(P<0.05),肝胰腺中MrGDH基因表达极显著高于对照组(P<0.01):说明MrTV感染胁迫可以刺激罗氏沼虾MrGDH的表达上调.

关键词：罗氏沼虾、罗氏沼虾太湖病毒、谷氨酸脱氢酶、基因克隆、组织表达差异

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分类号：Q17(水生生物学)

资助基金：国家自然科学基金2013skj002;浙江省自然科学基金LY12C19007;浙江省科技厅院所扶持专项2017F30033;浙江省湖州市公益性技术应用研究项目2015GZ09

在线出版日期：2017-12-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：639-648