基于四交群体的连锁图谱构建（英文）

摘要：

目前，遗传连锁图谱构建主要基于两纯系亲本交配的衍生群体，存在遗传多样性不足等局限，不适合于烟草等基因组多样性较低的物种，因为往往没有足够的多态性标记可用于图谱的构图，稀疏的标记图谱很难有效用于标记辅助选择及基因定位。本研究提出了基于四交群体的遗传图谱构建方法，通过计算机模拟验证了该方法的可行性和有效性，研制了配套的计算机分析程序。该方法的主要步骤及特点如下：1)基于最大似然法估计成对标记间的遗传距离；2)基于标记距离矩阵进行聚类分析，将标记分成不同的类群(连锁群)；3)对每一连锁群，先确定连锁群两端的标记，再通过3标记间遗传距离的比较，将其他标记逐步插入到合适的排列位置，最终确定整个连锁群的标记顺序。蒙特卡洛模拟证实了该方法可行、有效，且适用于其他2个自交系亲本交配的衍生群体。

关键词：四交群体、遗传距离、遗传图谱、连锁分析、蒙特卡洛模拟

分类号：Q348(遗传学分支学科)

资助基金：the National Natural Science Foundation of China.31271608;the Yunnan Provincial Tobacco Company Project.08A05;the CNTC Science and Technology Project.110200701023;the National Institutes of Health. DA025095

在线出版日期：2014-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：387-396