多倍体植物中单核苷酸多态性(SNPs)的开发

摘要：

单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由单核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性.在人、拟南芥、水稻等二倍体生物中,已经开发出大量的SNP标记并被用于群体结构分析、关联作图等研究,而在棉花、油莱、小麦等多倍体植物中,SNP的开发与应用却进展迟缓.为促进多倍体植物中SNP的开发,本文对多倍体植物中SNP标记开发所遇到的难题进行了阐述,并对多倍体中SNP标记开发方法进行了梳理,包括位点特异性引物的PCR片段直接测序,利用多倍体的近缘二倍体区分SNPs和部分同源序列间的差异(homoeologous sequence variants,HSVs),利用2代测序技术大规模发掘SNPs,基于公共数据库的序列通过生物信息学分析获取候选SNPs,通过遗传(分离)模式的研究验证SNPs等.利用上述方法可实现多倍体植物中SNP标记的大规模开发.

关键词：多倍体、单核苷酸多态性、标记开发、部分同源性

所属期刊栏目：37

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30971821;陕西省自然科学基金资助项目2010JQ3005;西北农林科技大学唐仲英育种基金资助项目A212020901

在线出版日期：2012-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：485-492