一个新的水稻TE的克隆及其与CACTA转座子结构的比较

摘要：

对水稻受稻瘟病菌诱导的新因子Rim2的基因组结构进行了研究.以Rim2 cDNA片段作探针, 筛选水稻BAC文库并对其亚克隆, 获得了一个基因组DNA克隆Rim2-569.序列分析表明, Rim2-569序列具备Class 2 转座子的基本结构特征.它两端具有完整的末端颠倒重复(TIRs), 若干正向和反向的亚末端重复 (STRs) , 以及插入位点3 bp的同向重复.它TIRs上的保守序列CACTG有别于以往报道的CACTA转座子.该因子包含一个开读框, 其预测蛋白与CACTA转座子编码的TNP2、TNPD等转座酶有低程度的同源性.该因子没有能够编码类似TNP1/TNPA 的DNA结合蛋白的开读框.Southern杂交显示, Rim2因子在多个不同起源的水稻品种上广泛存在,连同检索结果,证明该家族具有很多拷贝.上述特点表明, 该因子属于一个与CACTA转座子有一定差异的新的转座子大家族.

关键词：水稻、Rim2因子、基因组序列、分子结构

所属期刊栏目：30

分类号：Q74(生物小分子的结构和功能)

资助基金：国家自然科学基金30125030,90208010;中国科学院资助项目KSCXZ-SW-301

在线出版日期：2004-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：133-140