人脐带间充质干细胞与食管癌细胞融合后的转录组比较

摘要：

目的 探讨人脐带间充质干细胞(hMSCs)和食管癌细胞融合前后基因表达的差异和信号通路的改变.方法 分选和鉴定融合细胞(EMFs)后,通过基因芯片比较食管癌细胞、hMSCs和EMFs的表达谱.PCA聚类分析转录组的整体关系,LIMMA分析获得差异表达基因,PCC确定差异表达基因的表达模式,再通过DAVID、ToppGene和MSigDB数据库分析各个模式的基因功能、信号通路富集、染色体定位和富集,以KEGGanim和Idiographica分别绘制核心差异表达基因的信号通路关联图和染色体分布图.结果 EMFs细胞中DNA损伤修复、细胞周期阻滞和凋亡通路的核心基因高表达,为EC9706或hMSCs细胞的4倍(Pi ＜0.05),而抑制因子DUSP6的高表达可能负反馈地抑制促分裂素原活化蛋白激酶通路.hMSCs细胞中细胞因子和趋化因子高表达,为EC9706或EMFs细胞的2倍(Pi＜ 0.05),而EMFs细胞中33个免疫功能相关基因高表达,为EC9706细胞的2倍(Pi＜0.05).M期阻滞和氨基酸代谢相关的位于食管癌染色体扩增区的39个差异表达基因中,其中30个表达下降,为EC9706细胞的0.5倍(Pi＜0.05).结论 hMSCs和EC9706细胞融合后可能通过诱导促凋亡信号和DUSP6负反馈抑制机制来发挥抑制食管癌细胞的作用,免疫调节和分化相关基因的改变提示融合细胞继承了干细胞的部分免疫功能.

关键词：间质干细胞、脐带、食管肿瘤、细胞融合、转录因子

所属期刊栏目：36

分类号：R737.31;Q789;R382.5

资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）;国家高技术研究发展计划（863计划）

在线出版日期：2014-12-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：726-732