二代测序技术在肺癌组织相关基因突变检测中的临床应用价值

摘要：

目的 基于二代测序技术分析肺癌相关基因突变及位点分布状况,探讨突变基因与临床病理特征之间的关系及临床应用价值.方法 收集唐都医院呼吸与危重症医学科2017年12月至2018年6月行支气管镜活检和手术切除的肺癌组织样本53例,采用Illumina二代测序平台分别检测22个基因共103个突变热点区域,描述检测结果,统计分析高频突变基因与临床病理特征之间的关系.结果 22个肺癌相关基因中共检测到19个基因突变;103个肺癌相关突变位点中共检测到71个突变,其中肿瘤蛋白P53(TP53)基因的突变率为45.07％(32/71),表皮生长因子受体(EGFR)基因突变率为9.86％(7/71),细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因的突变率为8.45％(6/71),大肠癌K-鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)突变率为5.63％(4/71),肿瘤组织腺瘤样息肉病基因(APC)的突变率为4.23％(3/71),磷酸酰肌醇-3-激酶催化亚基(PIK3CA)、ERBB4、神经营养性酪氨酸激酶受体1(NTRK1)、SMO、KIT基因的突变率均为2.82％(2/71),GNAQ、CTNNB1、MAP2K1、ATM、成纤维细胞生长因子受体(FGFR3)、NOTCH1、上皮钙黏蛋白编码基因(CDH1)、成视网膜细胞瘤1(RB1)、HRAS基因的突变率均为1.41％(1/71).TP53突变者共有29例,其中3例患者具有双位点突变,共有32个突变位点.EGFR突变者共有6例,其中1例患者具有双位点突变,共有7个突变位点.CDKN2A突变均为单位点突变.TP53的5号外显子Val173Glu错义突变、8号外显子Arg273Leu错义突变、9号外显子Lys320Ter无义突变的突变率均为6.25％(2/32),其他位点突变率均为3.13％(1/32).EGFR的19号外显子Glu746Ala750del缺失突变、21号外显子Arg868Leu错义突变的突变率分别为42.86％(3/7)、28.57％(2/7),其他位点突变率均为14.29％(1/7).CDKN2A所有突变位点的突变率均为16.67％(1/6).TP53突变频率在低、中分化肺癌患者中较高,差异具有统计学意义(χ2=7.58,P=0.023).EGFR突变在病理类型(χ2=7.45,P=0.024)和分化程度(χ2=14.51,P=0.001)方面的差异具有统计学意义;临床各分期间比较,差异无统计学意义(χ2=6.37,P=0.081).结论 Illumina二代测序平台可作为分析肺癌多基因突变的检测手段,TP53、EGFR和CDKN2A突变频率较高,对肺癌的临床诊疗具有一定的指导意义.

关键词：二代测序、肺肿瘤、组织、基因、病理意义

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资助基金：空军军医大学附属唐都医院科技创新发展基金面上项目2017LCYJ016

在线出版日期：2019-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：103-108