链球菌感染与银屑病加重相关基因与功能通路的生物信息学分析

摘要：

目的 本研究拟在应用转录组测序得到的数据,探讨链球菌感染加重银屑病的可能基因.方法 基于链球菌感染与银屑病数据集(GSE158163,GSE14905),进行差异基因及功能通路富集分析.基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)找到银屑病及链球菌感染的关键模块,找出基于WGCNA的两个数据集的差异基因,并通过蛋白功能相似性筛选出排名前五的基因.随后构建出mRNA-miRNA关系网络.结果 GSE158163数据集筛选出上调基因1 614个,下调基因1 614个,GSE14905数据集筛选出上调基因1 568个,下调基因1 699个,得出271个交集基因;功能富集到炎症反应调节、白细胞活化、含胶原蛋白的细胞外基质等通路;随后构建WGCNA网络,得出37个交集基因与链球菌感染与银屑病相关;将这37个基因与之前差异表达的271个基因共同筛选,筛选出9个交集基因;在这9个基因中根据其表达蛋白功能的差异进一步筛选出排名前五的基因,分别为S100A9、S100A12、S100A8、LRG1以及TGFA.结论 本研究基于公共数据库筛选出了 5个链球菌感染和银屑病相关的基因,并论述了这些基因的病理生理机制,推测它们对两个疾病的影响.

关键词：银屑病、链球菌感染、生物信息学分析、基因、功能通路、病情

所属期刊栏目：33

分类号：R758.63(皮肤病学与性病学)

资助基金：全军保健专项科研课题18BJZ41

在线出版日期：2023-09-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2421-2426