mNGS检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用

摘要：

目的 探讨宏基因组高通量测序(mNGS)检测革兰阳性菌耐药基因的临床应用.方法 收集2021年4月1日—2022年4月1日南京医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科收治的249例呼吸道感染患者肺泡灌洗液标本微生物培养和mNGS检测结果,并进行革兰阳性菌耐药表型和抗菌药物耐药基因(ARGs)分析.结果 249份肺泡灌洗液标本通过mNGS检测到10种革兰阳性菌,以肺炎链球菌、假肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌为主;检出携带ARGs的革兰阳性菌4种,金黄色葡萄球菌ARGs有blaZ、mecA、mecR1、aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia、ant(9)-Ia、tet(K)、tet(L);粪肠球菌ARGs有tet(M)、dfr(E);屎肠球菌ARGs有tet(M);肺炎链球菌ARGs有tet(M).在3株携带ARGs的金黄色葡萄球菌中,青霉素耐药基因blaZ、甲氧西林耐药基因mecA、氨基糖苷类抗生素耐药基因aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia可较好地预测耐药表型,四环素耐药基因tet(L)预测的耐药表型与传统药敏培养结果一致性较差.结论 mNGS可检测出革兰阳性菌中ARGs,主要检出ARGs的革兰阳性菌有金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、屎肠球菌和粪肠球菌;金黄色葡萄球菌中检测到的耐药基因blaZ、mecA、aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia可较好地预测耐药表型.mNGS检测ARGs预测耐药表型有一定临床应用价值.

关键词：肺泡灌洗液、宏基因组高通量测序、革兰阳性菌、抗菌药物耐药基因、预测

所属期刊栏目：32

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;江苏卫生健康职业学院校级课题重大项目

在线出版日期：2022-11-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2721-2724