血流感染金黄色葡萄球菌分子生物学特征
目的 了解血流感染金黄色葡萄球菌分子分型、毒力基因及耐药基因携带情况,为临床诊疗提供依据.方法 收集2018-2020年山东省某医院血流感染金黄色葡萄球菌,通过全基因组测序(WGS)和生物信息学分析得到多位点序列分型(MLST)、毒力基因和耐药基因.微量肉汤稀释法测试对常用抗菌药物耐药性.利用核心基因组多位点序列分型(cgMLST)分析菌株间相关性.结果 共收集62株血流感染金黄色葡萄球菌,其中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)15株,检出7种STs,优势型别为ST59;甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)菌株47株,检出11种STs,以ST22最多见.检出31种毒力基因和16种肠毒素基因.耐药基因携带率高达98.4%(61/62),检出率最高的耐药基因为blaZ(83.9%,52/62),其次为erm(c)(41.9%,26/62)、mecA(24.2%,15/62).MRSA耐药基因检出率高于MSSA.对青霉素(96.8%,60/62)、红霉素(82.2%,51/62)、克林霉素(45.2%,28/62)耐药率较高.对利奈唑胺(1.6%,1/62)、替加环素(1.6%,1/62)耐药率较低,未发现万古霉素耐药菌株.cgMLST分析发现除两株菌无等位基因差异外,其余菌株均存在30~440个等位基因差异.结论 本院血流感染金黄色葡萄球菌优势型别为ST22,且在遗传信息上有较大差异,以散发感染为主.所有分离株携带毒力基因谱系丰富,耐药基因检出率高.
血流感染、金黄色葡萄球菌、全基因组测序、核心基因组多位点序列分型、耐药性
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R378.1+1(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
国家自然科学基金;十三五科技重大专项基金资助项目;山东省医药卫生科技发展计划基金资助项目
2022-08-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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