多种比例混合样本对新型冠状病毒核酸检测结果的影响
目的 利用真实的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测阳性咽拭子样本与不同比例SARS-CoV-2核酸检测阴性样本混合稀释,分析SARS-CoV-2核酸检测结果Ct值的变化,评估多种比例混合样本对新型冠状病毒核酸检测的影响.方法 选择解放军总医院海南医院已检测的不同SARS-CoV-2病毒载量的8个咽拭子标本,分别与随机4份等体积阴性咽拭子标本、9份等体积阴性咽拭子样本混合、19份等体积阴性咽拭子样本混合,各取200μl进行实时荧光反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测.另将8个阳性咽拭子样本分别与1份等量咽拭子阴性标本混合,分别进行RT-PCR.结果 总体积200μl的多混样本加样,ORF1ab基因Ct值从22.67~39.54,N基因Ct值从24.21~42.37,其中1例单ORF1ab基因阳性,1例单N基因再阳性.随着混合样本数量的增多,Ct值逐渐增大,高Ct值样本,随着混合样本数量的增多,开始出现阴性值.全部样本在5混下全部检出,10混及20混均漏检3例低Ct值样本.比较不同稀释混合比例同原倍样本检出结果的差异,发现2混、5混对Ct值无显著影响,10混、20混对Ct值影响显著(P<0.05).8个原始样本O基因Ct值从23.54~38.96,N基因Ct值从24.87~35.26,其中1例单O基因阳性,2例阴性.ORF1ab基因与N基因Ct值无明显差异,且2混合样本阳性比例7/8,高于原倍标本6/8.结论 随着各地疫情的逐步解除,国外输入及无症状感染者的跨地区输入,仍然给防控带来巨大压力,有限的检测能力是新型冠状病毒肺炎(COVID-19)大流行的主要瓶颈,需持续较长时间进行大规模筛查,占用大量人力资源、社会资源和经济资源,多样本混合尤其是10人份以下样本混合检测将有效提升检测效率、降低检测成本,提高防控能力.
混合样本;新型冠状病毒;实时荧光反转录聚合酶链式反应
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R378(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
国家老年疾病临床医学研究中心开放课题基金资助项目NCRCG-PLAGH-2017018国家慢性肾病临床医学研究中心开放课题基金资助项目kfkt202020解放军总医院科研扶持基金资助项目2018FC-WJFWZX-1-15
2021-11-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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