四川地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株基因型分析研究

摘要：

目的：建立水痘‐带状疱疹病毒（VZV ）新的测序分型方法，了解四川地区VZV临床分离株基因型特点，以达到水痘感染监控与预防的目的。方法对21株VZV病毒株进行序列比对，找出适用于clade分型的SNP位点；采集2012年1月－2013年12月医院临床诊断为水痘患者的疱疹液标本20份及五型VZV阳性参比质粒，测序检测SNP位点进行VZV 基因型分析。结果5个 SNP位点（36802T／C、51936A／C、83724A／G、70927C／A、50860C／A ）测序检测可以区分出clade 1～5型阳性参比品的基因型，临床疱疹液 VZV 检出14例，检出率为70．0％，其中13例为clade 2型、1例为clade 1型。结论该研究建立的测序法SNP检测可有效鉴别各型VZV ，四川地区VZV主要流行株为clade 2型，但clade 1型也有局部流行。

关键词：水痘-带状疱疹病毒、基因型、流行病学、DNA测序

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：成都军区十二五医学研究基金面上基金资助项目C1204四川省科技厅青年科技创新研究基金资助项目2013 T D0016

在线出版日期：2015-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：4586-4588