变形杆菌基因分型方法的评价

摘要：

目的筛选出适用于变形杆菌的最佳分型方法.方法用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、随机扩增多态DNA(RAPD)、重复元件序列PCR(Rep-PCR)和肠杆菌基因间重复共有序列PCR(ERIC-PCR)4种方法对44株变形杆菌进行基因分型.结果 RAPD可分为17型,分辨率系数为0.932;Rep-PCR可分为15型,分辨率系数为0.916;ERIC-PCR可分为23型,分辨率系数为0.941;PFGE可分为36型,分辨率系数为0.988.结论 PFGE、RAPD、Rep-PCR和ERIC-PCR 4种基因分型方法对变形杆菌进行分型,其分型力和分辨力均很好(均DI>0.90),其中PFGE分辨力最高,重复性好,但实验费用高,时间长,对大规模广泛应用有局限性;Rep-PCR和ERIC-PCR分辨率虽略底于RAPD,但重复性好,结果稳定,可广泛应用于多种菌属,不需要重复设计引物,易于实现标准化.

关键词：变形杆菌、基因分型、PCR

所属期刊栏目：12

分类号：R378.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金39970629

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：652-654