10.3969/j.issn.2095-3097.2023.04.007
HER2阳性乳腺癌铁死亡相关基因分析及预后预测模型的建立
目的 筛选影响人表皮生长因子受体2(HER2)阳性乳腺癌预后的铁死亡相关基因,并构建预测模型.方法 从癌症基因组图谱数据库收集乳腺癌患者肿瘤组织RNA-seq数据和临床资料,其中HER2 阳性乳腺癌185 例,HER2 阴性乳腺癌769 例.根据HER2 阳性和HER2 阴性乳腺癌铁死亡相关基因表达差异确定候选基因.比较不同铁死亡相关基因表达水平HER2 阳性乳腺癌的生存差异.应用Pearson相关性分析铁死亡相关基因的免疫相关性.通过Cox和LASSO回归分析,根据中位风险评分将HER2 阳性乳腺癌患者分为高风险组和低风险组,建立预后预测模型,并检验预测效能.结果 铁死亡基因FANCD2、TFRC、ATP5MC3、CS和NFE2L2 不同表达水平HER2 阳性乳腺癌患者生存率比较差异有统计学意义(P<0.05),其基因表达水平越高患者预后越差.上述 5 个铁死亡相关基因与免疫细胞存在相关性,其中CS与CD4+T细胞存在最明显正相关,CS与NK细胞和NFE2L2 与无特征细胞存在最明显负相关(P<0.01).HER2 阳性乳腺癌高风险组的生存率明显低于低风险组(P<0.05).预后预测模型对HER2阳性乳腺癌患者治疗后 3、5、8 年预后预测的曲线下面积分别为 0.776、0.844、0.853.结论 铁死亡相关基因FANCD2、TFRC、ATP5MC3、CS和NFE2L2 与HER2 阳性乳腺癌患者预后具有相关性,并且建立了预后预测模型,可有效预测HER2 阳性乳腺癌患者的预后.
乳腺肿瘤、铁死亡、人表皮生长因子受体2、基因、预后、预测、回归分析、影响因素分析
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R737.9(肿瘤学)
重庆市科卫联合医学科研项目;重庆市自然科学基金
2023-09-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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