α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱的生物信息学分析及其对新型冠状病毒肺炎潜在药物研究的意义

摘要：

目的 通过分析α干扰素抗病毒相关全基因组表达谱,探索其对新型冠状病毒肺炎的潜在治疗意义.方法 应用R语言对来自基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的α干扰素相关的全基因组表达谱开展差异分析、富集分析、蛋白互作分析,再应用自主研发的表观精准治疗预测平台(epigenomic preci-sion medicine prediction platform,EpiMed),寻找与α干扰素调控基因表达谱呈负相关的疾病类型,以及呈正相关的药物.结果 α干扰素对基因组表达谱影响复杂,其调控的核心基因有OAS1、MX1、OASL、ISG15、IST1、IRF7等,参与病毒生命周期的负调控、B细胞受体信号通路、肝炎、双链RNA绑定、人类免疫缺陷病毒感染,以及JAK-STAT信号通路等.进一步分析,α干扰素调控的基因组表达谱与社区获得性肺炎和脓毒症等感染性疾病呈高度负相关,而与利托那韦、利巴韦林、奈韦拉平、氟伐他汀呈高度正相关.结论 基于α干扰素抗病毒相关基因组表达谱的分析对于探索新型冠状病毒肺炎潜在治疗药物具有一定的借鉴意义.

关键词：α干扰素、新型冠状病毒肺炎、生物信息学、基因表达谱

所属期刊栏目：9

分类号：R511;R373(传染病)

资助基金：2017年度国家老年疾病临床医学研究中心招标课题;中国人民解放军总医院转化医学项目;上海浦东新区卫健委学科带头人计划;上海浦东新区中医治未病高峰学科;2019年度保健专项科研课题;军队保健人群老年共病的新型危险因素预警及干预研究

在线出版日期：2020-12-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：368-372