KRAS突变对人肺腺癌转录组影响的生物信息学分析

摘要：

目的 鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌是临床常见肺癌亚型,发病机制不清,预后不良.推测可能与KRAS突变对整个基因组的影响有关.本研究通过对KRAS突变型肺腺癌的转录组分析,探讨其预后不良和耐药的组学机制.为研究KRAS突变型肺腺癌的发病机制和临床治疗提供指导.方法 从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载KRAS突变型肺腺癌的转录组数据库,首先利用R语言Impute程序包进行数据标准化,然后利用Limma程序包筛选差异基因,最后利用Robust rank aggregation算法筛选显著性基因.为进一步研究其表观调控机制,我们利用R语言Clusterprofile程序包和STRING数据库分别进行了KEGG pathway分析和蛋白质互作网络分析.结果KRAS突变对全转录组影响复杂,包括改变细胞周期促进肿瘤细胞异常增殖;影响白细胞介素-17信号通路促炎反应导致免疫耐受,促进肿瘤生长;影响细胞色素P450信号通路导致耐药.结论 KRAS 突变能够引起整个基因组发生异常变化,并与促进肿瘤生长、抑制抗肿瘤免疫以及耐药相关基因的表达密切相关.

关键词：KRAS突变、肺腺癌、转录组、生物信息学

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分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：2017 年度国家老年疾病临床医学研究中心招标课题NCRCG-PLAGH-2017011;解放军总医院转化医学项目2017TM-020;解放军总医院临床科研扶持项目2016FC-ZHCG-1004;大数据背景下医学信息管理专业人才培养模式的改革研究重点J2016036;山西医科大学大学生创新创业校级项目20171053

在线出版日期：2019-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：75-79