HLA-A*02:251新等位基因克隆测序鉴定及序列分析

摘要：

目的 鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)A*02:251新等位基因,分析新等位基因遗传特征.方法 采用聚合酶链反应-测序分型法(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对组织配型健康供、患者进行HLA基因分型,发现先证者核苷酸杂合序列与已知序列不匹配,不能指定先证者HLA等位基因型,对先证者DNA扩增HLA-A位点第2～4外显子,PCR产物经克隆到PMD18-T质粒载体中以获得单链核苷酸序列,对克隆所得产物进行HLA-A基因的第2～4外显子双向测序分析.结果 发现先证者的一个HLA-A*02:06:01基因被确认,而另一个HLA-A基因为新等位基因,其序列被GenBank接受(编号为HM245348).新等位基因序列通过IMGT/HLA 数据库BLAST,与最相近的A*02:01:01:01相比,在第3外显子上有1个核苷酸的不同,即第383位 G>C,密码子 128 GAG→GAC,氨基酸由谷氨酸(Glu)→天门冬氨酸(Asp).供、患者HLA-A、B、C、DQB1位点等位基因不匹配.结论 该等位基因为新的HLA-A*02:251等位基因.中国人群HLA-A 位点第3外显子核苷酸序列存在多态性.

关键词：人类白细胞抗原、等位基因、外显子

所属期刊栏目：28

分类号：R551.3(血液及淋巴系疾病)

资助基金：深圳市科技局立项项目20092119

在线出版日期：2011-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：300-303