子宫内膜癌相关基因的生物医学文本分析研究

摘要：

目的:寻找与子宫内膜癌发生、发展相关的关键基因.方法:从医学信息检索平台Coremine Medical中筛选出与子宫内膜癌关系最为密切的几种关键基因,再利用生物医学文本挖掘工具Chilibot对从PubMed中获取的相关文献摘要进行分析,深入探究关键基因与子宫内膜癌之间的相互关系,并通过UALCAN在线工具分析关键基因的表达水平和甲基化水平.结果:确定了与子宫内膜癌关系最密切的5种关键基因.在子宫内膜癌组织中,MLH1基因的甲基化水平比正常子宫内膜组织的甲基化水平要高(P<0.001),MLH1基因甲基化的发生导致了DNA错配修复基因的突变,从而促进了子宫内膜癌的发生.与正常子宫内膜组织相比,MSH2基因和PMS2基因在子宫内膜癌组织中表达量较高(P<0.001),MSH6基因和抑癌基因PTEN在子宫内膜癌组织中的表达均比正常子宫内膜组织表达要低(P<0.001).错配修复基因MLH1、MSH2、MSH6以及PMS2的突变,促进了相应修复蛋白的缺失,进而导致了子宫内膜癌的发生、发展.结论:错配修复基因MLH1、MSH2、MSH6、PMS2以及抑癌基因PTEN是子宫内膜癌发生、发展的关键基因.

关键词：生物医学文本挖掘、子宫内膜癌、关键基因、CoremineMedical、Chilibot

所属期刊栏目：28

分类号：R737.33;TP311.13(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金"内脂素调控CD4+T细胞介导的免疫微环境促进子宫内膜癌进展的机制研究"81772790;"CAFs分泌CXCL12调控MDSCs活化和功能促进子宫内膜癌进展的机制研究"81802617;"DENND1A 调控 Rab35/PI3K 信号通路促进子宫内膜癌恶性进展的机制研究"81602293;天津市科学委技术委员会自然科学基金"肿瘤微环境中 CAFs 通过 CXCL16/CXCR6轴促进子宫内膜癌恶性进展的机制研究"18JCQNJC81200

在线出版日期：2019-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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