应用血浆微生物游离DNA测序预测造血干细胞移植患者血流感染病原体

摘要：

目的:通过血浆微生物游离DNA（mcfDNA）额外扩增和非额外扩增测序，预测造血干细胞移植（HSCT）患者血流感染（BSI）病原体。方法:前瞻性采集2021年3—7月北京大学人民医院978例HSCT患者移植前预处理期至移植后4个月间的7 428份临床剩余血样，分离血浆并冷冻保存。依据血培养结果和是否留有BSI发病前样本等，最终共纳入28例血培养阳性（39份BSI发病前1~8天的血浆）和9例血培养阴性（9份血浆）的HSCT患者。39份血浆样本进行mcfDNA额外扩增和非额外扩增测序；9份血浆样本进行额外扩增测序。以血培养结果为金标准，比较测序结果与血培养结果的一致性。使用Student
t检验和Wilcoxon检验进行统计学分析。
结果:未经额外核酸扩增的测序分析显示，仅有7份样本的测序结果与血培养结果一致，总病原检出率为17.95%（7/39），发病前3天内和4~8天内的检出率分别为23.81%（5/21）和2/18。主要检出的病原类型为革兰阴性菌（5/7）。而经额外扩增测序的总病原检出率为59.26%（16/27），且BSI发病前3天内的检出率为8/13。与未经额外扩增测序相比，额外扩增测序结果中革兰阳性菌的检出增加（13/16），检测到额外微生物的数量显著增加（
t=3.440，
P=0.001）。此外，血培养阴性患者9份血浆样本的额外扩增测序结果显示，6份样本均未检出病原体，3份样本仅检出HSCT患者常见的细环病毒。
结论:HSCT患者BSI发病前血浆mcfDNA额外扩增测序的病原体检出率优于非额外扩增测序，且在前3天内的检出率更高，具有预测BSI病原体的潜能。

关键词：造血干细胞移植、血流感染、病原体、预测、微生物游离DNA测序

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资助基金：国家杰出青年科学基金81625014;National Science Foundation for Distinguished Young Scholars81625014

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1267-1274