圆盘式微流控芯片在脑梗死患者CALR基因突变检测中的初步应用

摘要：

目的:建立基于圆盘式（CD）微流控芯片的CALR基因突变的快速检测方法，初步评价其用于脑梗死患者CALR-1和CALR-2基因突变检测的应用价值。方法:基于微流控技术和环介导等温扩增（LAMP）技术建立一个用于CALR-1和CALR-2基因突变同步检测的CD微流控芯片检测平台，并验证该平台检测的灵敏度、特异性、重复性和准确性。前瞻性选取2019年11月至2021年3月复旦大学附属华山医院收治的124例脑梗死患者为脑梗死组，80名健康体检者为对照组。用CD微流控芯片法检测抗凝外周全血样本中的CALR-1和CALR-2基因突变情况，每块芯片同时检测4个样本，同步检测每个样本的3个指标，等温扩增40 min后读取结果。同时采用测序法对检测结果进行验证，比较2种检测结果的一致性。结果:采用CD微流控芯片平台，无需热循环，40 min即可完成样本中3个指标的同步扩增，样本的整个检测过程在60 min内完成。对核酸靶标浓度较高的样本，扩增10 min即可出现阳性信号，收到样本后30 min内报告检测结果。CD微流控芯片法针对CALR-1和CALR-2的检测灵敏度分别为1.0%和0.5%突变负荷浓度，对于其非靶标的核酸样本均未发生任何非特异性扩增，特异性良好，批内重复性和批间重复性的符合率均为100%（20/20）。在脑梗死组中发现2例CALR基因突变，且均为CALR-1突变（L367fs*46），对照组中未发现CALR-1和CALR-2基因突变。CD微流控芯片法与测序法结果一致率为100%（204/204）。结论:CD微流控芯片法用于检测脑梗死患者样本中CALR-1和CALR-2突变具有灵敏度高、特异性好、检测速度快和检测通量高等优势，有助于明确脑梗死患者的病因。

关键词：脑梗死、钙网蛋白、基因、微流控芯片、分子诊断技术

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资助基金：国家自然科学基金81871728;上海市科学技术委员会“科技创新行动计划”20S31902700，21Y11900600;National Natural Science Foundation of China81871728;"Science and Technology Innovation Action Plan"of Shanghai Science and Technology Commission20S31902700, 21Y11900600

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：45-50