结直肠癌患者癌组织定植菌群结构与组分变化分析

摘要：

目的 探讨结直肠癌患者癌组织定植菌群结构和组分变化,分析肠道定植菌群与结直肠癌发生发展的关系.方法 回顾性研究.收集2016年1月至2017年10月同济大学附属同济医院院行胃肠外科手术的乙状结肠28份位置匹配的组织样本为结直肠癌组,同期收集12份健康体检者正常肠黏膜组织样本为对照组.采用Illumina Miseq测序技术进行细菌16S rRNA基因V3-V4区测序,分析并比较正常肠黏膜组织和癌组织定植菌群结构与组分差异.统计学方法采用Mann-Whitney检验.结果 正常肠黏膜组织与癌组织定植菌群的结构存在显著差异.在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在癌组织中的丰度显著偏低(Z=-1.964,P＜0.01),而变形菌门(Proteobacteria)在癌组织中的丰度则显著偏高(Z＝-1.997,P＜0.01);在属水平,拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特菌属(Blautia)、普雷沃菌属(Prevotella)和普拉梭菌(Faecalibacteriu)等在癌组织中的丰度明显低于正常肠黏膜组织(Z=-3.008,P＜0.05);仅在正常肠黏膜组织定植且丰度排前3位是布赫纳什菌属(Buchnera)、普氏菌属(Prevotella)和普雷沃菌科(Prevotellaceae),仅在癌组织定植且丰度排前3位是卡氏菌属(Catonella)、库特菌属(Kurthia)和短单胞菌属(Brachymonas).结论 通过鉴定肠黏膜组织定植菌群结构及成分变化可能成为一种准确、低成本的CRC早期诊断指标,从而为CRC的预防和治疗指明新的途径.

关键词：结直肠肿瘤、肠黏膜、胃肠道微生物组、高通量核苷酸序列分析、生物标记、肿瘤

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资助基金：国家自然科学基金81472179,81873975;上海市医疗卫生优秀学科带头人培养计划资助2018BR31;中央高校基本科研业务费专项资金资助22120170071;上海市同济医院临床培育项目[ITJZD 1803,GJPYI804]National Natural Science Foundation of China81472179,81873975;the Excellent Academic Leader Training Program of Shanghai Health System2018BR31;the Fundamental Research Funds for the Central Universities22120170071;the Clinical Research and Cultivation Project of Shanghai Tongji HospitalITJZD 1803,GJPY1804

在线出版日期：2019-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：44-50